Con objeto de reducir los costes del censo y disminuir al mínimo la carga de trabajo de los informantes, la recogida de datos se está efectuando en tres fases diferenciadas.
La primera fase se ha realizado entre el 1 de octubre y el 31 de diciembre de 2009. Los titulares agrarios han recibido, via postal, un cuestionario censal para cada una de las explotaciones agrícolas y/o ganaderas de las que son titulares, junto con las instrucciones para su correcta cumplimentación. El cuestionario cumplimentado se ha remitido al INE en el sobre de franqueo pagado que se adjuntó con la documentación censal enviada. También se podía cumplimentar a través Internet en la dirección habilitada hasta el 28 de febrero de 2010.
La segunda fase se está realizando a partir del 1 de enero de 2010. En esta fase, complementaria de la anterior, se están efectuando entrevistas telefónicas asistidas por ordenador, bien para cumplimentar directamente el cuestionario censal o para contrastar datos del cuestionario cumplimentado en la fase anterior.
Simultáneamente a esta fase, desde el 1 de enero de 2010, se están realizando entrevistas presenciales a aquellos titulares que hayan sido seleccionados en una muestra aleatoria para recolectar datos complementarios sobre métodos de producción de las explotaciones agrarias.
Toda la información proporcionada quedará protegida por el Secreto Estadístico (Ley de la Función Estadística Pública de 9 de Mayo de 1989, BOE del 11 de mayo de 1989), lo que implica que únicamente podrá utilizarse de manera agregada, sin incluir ninguna referencia de carácter individual. Por otra parte la Ley 13/1996 (BOE del 31 de diciembre de 1996) determina la obligatoriedad de la cumplimentación del cuestionario censal.